1、增值税及附加(卖方承担)：按转让收入与购置原价差额的5%计征增值税，附加税费(城建税、教育费附加等)按增值税税额的12%左右(市区标准)缴纳，无年限免征优惠，回迁商铺多为非住宅，不适用住宅增值税减免政策。

2、个人所得税(卖方承担)：能提供房产原值及合理费用凭证的，按(转让收入-房产原值-合理费用)×20%据实征收;无法提供的，按转让收入的1%-3%核定征收(各地标准不同)。

3、土地增值税(卖方承担)：实行四级超率累进税率(30%-60%)，可提供原购房发票的，按(转让收入-扣除项目)×对应税率计算;不能提供的，部分地区按转让收入的5%-8%核定征收，亏损交易可申请免征。

4、契税(买方承担)：税率3%-5%(各地不同，商铺多按3%)，若交易价中相当于拆迁补偿款部分可免征，超出部分按规定税率征收。

5、印花税(买卖双方均需缴纳)：按合同金额的0.05%计征，交易双方各承担一半，部分地区电子版合同可免征。

6、土地出让金(特殊情况，卖方承担)：若回迁商铺土地性质为划拨，上市交易需按当地政策补缴土地出让金，具体标准以当地国土部门规定为准。

7、交易手续费(买卖双方承担)：非住宅类一般10元/㎡，买卖双方各承担一半，各地标准有差异。

8、产权登记费(买方承担)：非住宅类550元/套，用于办理不动产权证。

回迁商铺上市交易的土地出让金如何计算

回迁商铺(划拨转出让)的土地出让金计算以地方基准地价与补缴规则为核心，无全国统一标准，核心计算要点按点罗列如下：

1、先确定核心前提，仅土地性质为划拨的回迁商铺上市交易才需补缴，出让性质无需缴纳;补缴主体、比例、基准地价以当地不动产登记中心/自然资源局现行政策为准。

2、计算核心公式(通用基准地价法)：土地出让金=商铺分摊土地面积×商业用途基准地价×补缴比例×年期修正系数×(区位/容积率/楼层)修正系数。

3、商铺分摊土地面积计算：可通过“商铺建筑面积×整幢建筑总用地面积÷整幢建筑总建筑面积”得出，无精确数据时按此公式测算分摊面积。

4、商业用途基准地价：按商铺所在土地级别对应的商业用地基准地价(各地定期更新公布)，非住宅用途基准地价通常高于住宅。

5、补缴比例：多数地区商业划拨转出让按基准地价的40%确定，部分城市按土地级别调整(如30%-50%)，具体以当地规定为准。