根据《国家税务总局关于增值税简易征收政策有关管理问题的通知》(国税函〔2009〕90号)规定：“二、纳税人销售旧货，应开具普通发票，不得自行开具或者由税务机关代开增值税专用发票。”因此，公司转让上述旧固定资产设备属于销售旧货，按照简易办法依照3%征收率减按2%征收增值税，开具普通发票。