亏损的企业，如果有符合加计扣除的情形，比如研发费用加计扣除等事项的，如果企业平时季度有申报预缴所得税，这种情况下企业应该申请退税，将预缴的金额退还，另外一种是企业平时预缴，这样形成的亏损金额可以以后弥补。