进项专用发票已认证负数发票做进项税额转出处理。

借：库存商品等 借方红字，

贷：应付账款等 贷方红字，

贷：应交税费-应交增值税-进项税额转出 贷方蓝字，

申报增值税的时候填写增值税纳税申报表附列资料（二），二、进项税额转出额，20栏，红字专用发票信息表注明的进项税额。