当自然人股东决定退出投资时，若该企业为非合伙制公司，则需缴纳印花税及个人财产转让所得所得税。税率统一设定为20%。计算应纳税所得额时，采用以下公式：应纳税所得额=个人从股权转让中获得的全部收入（包括违约金、补偿金、赔偿金以及其他任何名义的回收款项）减去原始实际投资额及相关税费。另一方面，如果撤资的主体是法人股东，那么除了需要支付印花税之外，还必须承担企业所得税的责任。