在前往办税服务厅申请代开发票时，企业需准备以下文件：营业执照、公司公章、代开发票申请表以及相关合同等。

关于代开发票的会计处理，具体操作如下：

首先，企业应将收到的款项记入“应收账款”等相关科目。

随后，确认收入并记录主营业务收入，同时根据适用税率计算相应的增值税额。

最后，将这部分应交增值税从“应交税费—应交增值税”账户中转出至“银行存款”。

此外，当实际缴纳增值税时，还需进行额外的会计分录：

借方记入“应交税费—应交增值税”，贷方则对应增加“银行存款”。

这样不仅保证了税务合规性，同时也确保了财务报表的准确性和完整性。