根据《企业会计准则第1号--存货》第二十一条规定，企业在处理存货毁损时，应将处置收入扣除账面价值和相关税费后的金额计入当期损益。具体处理方法如下：
首先，当存货报废发生时，如果原因尚待查明，应将其作为待处理财产损溢进行核算。会计分录为：借记待处理财产损溢，贷记原材料等，同时应交税费—应交增值税（进项税额转出）。
其次，当企业取得产品报废收入时，应进行相应的会计分录。借记银行存款等，贷记其他业务收入，同时应交税费—应交增值税（销项税额）。
最后，企业需要将报废的存货成本从待处理财产损溢中转出，计入其他业务成本。会计分录为：借记其他业务成本，贷记待处理财产损溢。
综上所述，企业在处理存货毁损时，应遵循《企业会计准则第1号--存货》的规定，通过适当的会计分录进行处理。这有助于确保企业财务报表的准确性和可靠性，为企业的经营决策提供有力支持。