个人开运输费发票需要按照劳务代扣代缴个人所得税，个税的税率为20-40%税率不等。
首先要使用不含税收入进行征上，具体如下：
1. 不含税收入*（1-20%）*适应税率， 适用税率根据收入的不同有所区别， 2. 2万以下20%， 3. 2-5万之间，30%速算扣2000， 4. 5万上40%速算扣7000。
补充：综合所得主要包括哪些内容？
综合所得是指居民个人取得的工资、薪金所得；劳务报酬所得；稿酬所得和特许权使用费所得。
工资薪金所得收入额=全部工资薪金税前收入， 劳务报酬所得收入额=全部劳务报酬税前收入×（1-20%）， 稿酬所得收入额=全部稿酬税前收入×（1-20%）×70%， 特许权使用费所得收入额=全部特许权使用费税前收入×（1-20%）。